一、个人总结：
1、胞内蛋白：由游离的核糖体合成，包括，呼吸酶DNA聚合酶、各种转氨酶、DNA解旋酶、RNA聚合酶等细胞生命活动必需的酶。
2、分泌蛋白：先是游离的核糖体合成，在信号肽的引导下，到内质网上加工，再经高尔基体，最后通过细胞膜分泌出去，包括，唾液淀粉酶，胃蛋白酶，消化酶，血浆蛋白，抗体和一部分激素。
3、特殊情况：溶酶体中的水解酶，也需要内质网、高尔基体的参与。
二、专业解读：
《细胞内蛋白分选与蛋白运输》←点击查看原文
6.3.1 分选信号：信号肽（信号序列）和信号斑
1.信号序列（signal sequence）是存在于蛋白质一级结构上的线性序列，通常15-60个氨基酸残基，有些信号序列在完成蛋白质的定向转移后被信号肤酶切除。
2.信号斑（signalpath）：存在于完成折叠的蛋白质中，构成信号斑的信号序列之间可以不相邻，折叠在一起构成蛋白质分选的信号。
6.3.2 信号作用：信号序列决定蛋白质的正确运输方向。【补充：经查资料，ER应该是内质网的简称】
6.3.3 信号结构：长度一般为15~35个氨基酸残基，N-末端含有1个或多个带正电荷的氨基酸，其后是6~12个连续的疏水残基；在蛋白质合成中将核糖体引导到内质网，进入内质网后通常被切除。
6.3.4 信号类型：根据信号序列运输方向的不同分为三种类型，即入核信号、引导肽和信号肽。
1.入核信号指导核蛋白的运输；
2.引导肽指导线粒体、叶绿体和过氧化物酶体蛋白的运输；
3.信号肽则指导内膜系统的蛋白质运输。
6.3.5 分选信号假说内容：
核糖体同内质网的结合受制于mRNA中特定的密码序列（可以翻译成信号肽），具有这种密码序列的新生肽才能连同核糖体一起附着到内质网膜的特定部位。因此，核糖体同内质网的结合是功能性结合，具有功能性和暂时性，并受时间和空间的限制。
信号序列的两个基本作用是：（1）通过与SRP的识别和结合，引导核糖体与内质网结合；（2）通过信号序列的疏水性，引导新生肽跨膜转运。
三、分子伴侣：帮助蛋白折叠、解折叠，并帮助错误蛋白重新折叠，自己不参加分子的最后合成。如HSP70、HSP0，泛素等。
6.3.6 蛋白的膜泡运输
内质网中合成的蛋白是以膜泡形式运往各处的。膜泡的类型有：网格蛋白小泡、COPII被膜小泡、COPI被膜小泡三种。
1.网格蛋白小泡：介导从反面高尔基体网络到细胞质膜、从细胞质膜到反面高尔基网络的运输。二者的衔接蛋白是不同的。
2.COPII被膜小泡：这种类型的小泡是介导非选择性运输的小泡，它参与从ER到顺面高尔基体、从顺面高尔基体到高尔基体中间膜囊、从中间膜囊到反面高尔基体的运输。这种小泡的外被是外被蛋白COPII复合体。
3.COPI被膜小泡：主要介导蛋白质从高尔基体运回内质网，包括从反面高尔基体运向顺面高尔基体，以及将蛋白质从反面高尔基体运回到内质网。【类似文章链接】
6.3.7细胞内蛋白转运方式的途径
1.穿膜运输：胞质溶胶中合成的蛋白质进入到内质网、线粒体、叶绿位和过氧化物酶体等则是通过跨膜机制进行运输的，需要膜上运输蛋白的帮助，被运输的蛋白要有信号肽或导肽。
2.门控运输：胞质溶胶中合成的蛋白质穿过细胞核内外膜形成的核孔进入细胞核，被运输的蛋白需要有核定位信号。
3.膜泡运输：蛋白质从内质网转运到高尔基体以及从高尔基体转运到溶酶体、分泌泡、细胞质膜、细胞外等则是中小泡介导的，这种小泡称为运输小泡。
四、其他参考：←点击查看原文
蛋白质的分选大体可分两条途径：一条是在细胞质基质中完成多肽链的合成，然后转运至膜围绕的细胞器，如线粒体、叶绿体、细胞核及细胞质基质的特定部位。另一条途径是蛋白质合成起始后转移至粗面内质网，新生肽边合成边转入粗面内质网腔中，随后经高尔基体运车溶酶体、细胞膜或分泌到细胞外，内质网与高尔基体本身的蛋白成分的分选也是通过这一途径完成的。
此图概括为（个人理解）：
1、游离的核糖体合成的蛋白质后去向：
（1）细胞质基质，有呼吸酶、脱水缩合酶、血红蛋白等。
（2）具膜结构细胞器，有叶绿体、线粒体、过氧化物酶体等中的蛋白质。
（3）细胞核，RNA聚合酶、DNA解旋酶、核糖体蛋白质、染色体蛋白质等。
2、游离的核糖体经信号肽引导到内质网，再经高尔基体分选后去向：
（1）质膜蛋白，如载体、受体等。
（2）溶酶体中蛋白质，如水解酶。
（3）分泌蛋白，如消化酶、血浆蛋白、抗体、部分激素等。